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紧接着团队计算了AlphaFold2预测的人类蛋白质组结构的TM分数。测试集的蛋白结构实验解析覆盖率均小于一半，序列长度至少600个残基。结果中有187个蛋白质的TM>0.8，343个蛋白质的TM>0.7。虽然预计AlphaFold的域间准确度会低于其域内准确度，但这组数据表明AlphaFold2模型在多结构域复合体的预测上同样表现优异。

蛋白结构的准确预测能够为生物学研究带来丰富的启示。研究团队在文章中提到了三个不同案例。所有的结构预测都是从头开始的，对象均具有少于25%序列同源性或结构解析覆盖少于20%。