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与海航集团的实际控制人为慈航基金不同的是，至今在海南航空控股公司的年报所表明的的实际控制人为海南省国资委。

不可否认的是地方政府在海南航空的发展历程中起着非常重要的作用，启动资金是来自于海航省政府的资金。