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○ 整个人类蛋白质组（98.5%的人类蛋白质）被AlphaFold破译，极大地扩展了蛋白结构覆盖率。

○ 由此产生的数据集包含了58%的残基具有较高置信度，其中一个子集（占所有残基的36%）具有非常高的置信度。

○ 蛋白结构的准确预测带来了高质量的生物学假设，将进一步的激发基础科学、药物研发、合成生物学设计方面的未来发展。

○ Deepmind将通过一个公共数据库（由欧洲生物信息学研究所托管，网址：https://alphafold.ebi.ac.uk/）向社会免费提供所有AlphaFold2的蛋白质预测结果。

杨宗颖 纽卡斯尔大学 / 校对

在全世界科研机构的共同努力下，现在已经有超过50000个人类蛋白质结构被解析，使智人成为迄今为止在蛋白质数据库（PDB）中最具有代表性的物种。

AlphaFold2用一个范围是0到100的指标pLDDT来衡量单个残基的置信度：将pLDDT>90作为高准确度的分界点，pLDDT>70的较低临界值对应于一个普遍正确的骨架预测。下图显示了AlphaFold2在不同pLDDT范围内对一个示例蛋白质的准确性情况。

从AlphaFold2的预测结构来看，在人类蛋白质组中，有35.7%的残基落在最高精度带内（相当于38.6%的残基产生了可信的预测结果）。这是现有通过实验所得结构数量的两倍。58.0%的残基被有把握地预测（pLDDT>70），这意味着AlphaFold2也为PDB中没有良好结构的序列增加可观的覆盖率（原有的结构解析度低于30%）。对于单个蛋白质的预测来说，43.8%的蛋白质中有至少四分之三的序列被有把握地预测。

以前的许多大规模结构预测工作都集中具有独立折叠能力的单结构域上。但这会带来一些问题：